Большое спасибо

Уважаемые форумчане, хотел бы предложить на ваше рассмотрение материал одного человека, генетика по образованию, но который по своему алгоритму для Бейсика создал программу по конвертации генов в музыку. Могу ли я здесь это осветить? Или перейти на какой то другой специализированный сайт? Я таких не нашел А вот идею этого человека, думаю, возможно воплотить и в SPOOKY-2

У меня есть много его работ и его алгоритм для Бейсика. По этому алгоритму на Бейсике сам повторил некоторые его файлы. Хотя я знаю и его домашний адрес, и его емаиль, но вот контакт с ним установить не могу. Не знаю, что с ним. Материал его есть в открытом доступе. Если будет это необходимо, дам ссылку.

МУЗЫКА ГЕНОВ ВИРУСА ГЕРПЕСА ТИПА 2.КУРНОСОВ МИХАИЛ НИКОЛАЕВИЧ.10 января 2011.COPYRIGHT.<C>.

Я создал музыку генов герпес-вируса типа 2 по алгоритму, сообщенному мной
ранее на моем сайте WWWNEOGERMETIC.NAROD.RU.
Прежде всего хочу сказать, что последовательность нуклеотидов ДНК геномов или
генов разных организмов от человека до самых простых вирусов можно преобразовать в любую другую информационную последовательность. Это может быть
текст из букв какого-то языка, это может быть последовательность разных
звуков [как в музыке генов],последовательность световых, цветовых сигналов,
различных полевых импульсов - СВЧ-излучения, модуляции электростатического поля,
разное лазерное когерентное излучение и другое.

То есть последовательность нуклеотидов ДНК , РНК или белка можно преобразовать в
любую другую информацию, носителем которой может быть любая другая материя.

Но обратный процесс, а именно влияние этих физических материй ,созданных на
основе кода молекулы ДНК, РНК или белков ,на сами молекулы вряд ли возможно
в смысле специфичности воздействия. Иначе говоря вряд ли музыка генов окажет
какое-то влияние в нужном направлении на гены или белки.
Пока мне про это ничего не известно.
Возможно достичь какое-то неспецифическое действие, например повышение
температуры раствора, но для этого не надо заниматься преобразованиями
одного информационного кода или сообщения в другое.

Эта музыка генов вируса герпеса просто демонстрация возможности преобразования одной информационной последовательности в другую.

Предлагаю всем желающим студентам, биологам ,медикам для научного изучения
этой музыки генов попробовать получить какие-то экспериментальные результаты
по ее воздействию на биологические объекты. А именно вирусы, бактерии, клетки,
многоклеточные организмы.

Все это делается на самой простой машине - процессор 386sx33,на выход
системного динамика с сопротивлением 8 ом и мощностью 0,5 ватта подключается более мощный динамик. Испытано хорошо динамик 2ГДШ3 с сопротивлением
8 ом. Звук более громкий и приятный, чем от маленького динамика.
Для создания и проигрывания музыки генов используется программа
QBASIC.EXE версия 1.1 ,входящая в состав MSDOS 6.22 ,также используется
программа EDIT.COM ,входящая в эту же  DOS.Эти программы
будут работать и на операционной системе WINDOWS XP.Этот звук можно
вывести на дистанционный динамик для влияния на биообъекты.
В окне QBASIC надо открыть программный файл, например 75.BAS
и нажать клавишу F5 - RUN.Программисты-профессионалы могут, конечно,
сделать какой-то шедевр для этих целей для WINDOWS,но мне достаточно и
QBASIC.

Чтобы изучить любой ген ,надо загрузить его последовательность
из хранилища - NCBI по адресу WWWNCBI.NLM.NIH.GOV или с любого зеркала.

Частоты звуков, кодируемые QBASIC следующие.

   НОТА  ДО  РЕ  МИ ФА  СОЛЬ  ЛЯ  СИ
  БУКВА   C   D   E  F     G   A   B

5 ОКТАВ     О1        О2        О3            О4          О5         

ЧАСТОТЫ 130-247   261-494   523-988     1047-1975   2092-3950
ГЕРЦ

Например, значение O1B - нота  СИ малой октавы ,ее частота - 247 Герц.
Перед каждой мелодией стоит PLAY "L12" - это темп или скорость мелодии.

Более точные значения для оператора SOUND и PLAY надо читать руководство
по программированию в среде QBASIC.Если у вас будет затруднение с преобразованием последовательностей нуклеотидов или аминокислот в звуки, то
обращайтесь ко мне, так как я делаю это довольно быстро .Так все белки
вируса герпеса я превратил в музыкальные файлы примерно за час работы.

Для того, чтобы музыку сопоставить как-то со структурой белка, я привожу здесь
ФАСТУ вируса герпеса 2 - приложение 2,и составленный мной список названий белков
и их функций - ПРИЛОЖЕНИЕ 1.
Файлы генной музыки с расширением .BAS находятся в конце статьи. ПРИЛОЖЕНИЕ 3.
Для прослушивания надо текст стандартными приемами WINDOWS перенести в окно
QBASIC.Файл должен иметь обязательно расширение .BAS ,например, 75.BAS.
Лучше файл сохранить рядом с программой QBASIC,чтоб ее было легче найти и открыть.

--------------------------------------------------------------------------------------
БЕЛКИ ВИРУСА ГЕРПЕСА ТИПА 2 ПО ПОРЯДКУ РАСПОЛОЖЕНИЯ В ГЕНОМЕ.ПРИЛОЖЕНИЕ 1.

СПИСОК СОСТАВИЛ КУРНОСОВ М.Н.ПО ДАННЫМ ЛОКУСА NC_001798 ГЕНОМА ВИРУСА,
ОТ 18 СЕНТЯБРЯ 2007 ИЗ NCBI USA.

ЭТОТ СПИСОК Я СОСТАВИЛ ДЛЯ СОПОСТАВЛЕНИЯ ФУНКЦИИ И СТРУКТУРЫ БЕЛКОВ
ВИРУСА ГЕРПЕСА 2 С МУЗЫКОЙ ГЕНОВ ,СОЗДАННОЙ МНОЙ ПО ЭТИМ БЕЛКАМ.

ВСЕГО 77 БЕЛКОВ, ИЗ НИХ 8 ИМЕЮТ НЕИЗВЕСТНУЮ ФУНКЦИЮ.

1.virion protein; inhibits stress-induced translational arrest;
  related to eIF2 phosphatase regulatory subunit GADD34; binds protein
  phosphatase 1 to form a holoenzyme capable of dephosphorylating eIF2-alpha
  neurovirulence protein ICP34.5.

2.ubiquitin E3 ligase ICP0,gene regulation function,cellular protein
  degradation,latency,contains a RING finger; disrupts ND10;proteasome
  -dependent degradation of several cellular proteins.

3.envelope glycoprotein L,function cell entry; cell-to-cell spread,contains a
  signal peptide; complexed with envelope glycoprotein H.

4.uracil-DNA glycosylase,DNA repair.

5.nuclear protein UL3,function unknown,colocalizes with regulatory protein ICP22
  and nuclear protein UL4 in small, dense nuclear bodies.

6.nuclear protein UL4,function unknown,colocalizes with regulatory protein ICP22
  and nuclear protein UL4 in small, dense nuclear bodies.

7.helicase-primase helicase subunit,DNA replication.

8.capsid portal protein,function DNA encapsidation,dodecamer located at one
  capsid vertex in place of a penton.

9.tegument protein UL7,function virion morphogenesis.

10.helicase-primase subunit,DNA replication.

11.DNA replication origin-binding helicase,DNA replication.

12.envelope glycoprotein M,function virion morphogenesis,membrane fusion,
   type 3 membrane protein; 8 transmembrane domains;complexed with envelope
   glycoprotein N.

13.myristylated tegument protein,function virion morphogenesis,
   envelope-associated.

14.deoxyribonuclease,DNA processing.

15.tegument serine/threonine protein kinase,function protein phosphorylation,
   PK family.

16.tegument protein UL14,virion morphogenesis.

17.DNA packaging terminase subunit 1,function DNA packaging into
   capsids,contains an ATPase domain.

18.tegument protein UL16,function possibly virion morphogenesis,putative
   initiation codon is CTG.

19.DNA packaging tegument protein UL17,function capsid transport,
   capsid-associated.

20.capsid triplex subunit 2,function capsid morphogenesis,complexed 2:1 with
   capsid triplex subunit 1 to connect capsid hexons and pentons; VP23.

21.major capsid protein,function capsid morphogenesis,6 copies form hexons,
   5 copies form pentons; VP5.

22.envelope protein UL20,function virion morphogenesis,membrane fusion.

23.tegument protein UL21,function virion morphogenesis ,interacts with
   microtubules.

24.envelope glycoprotein H,function cell-to-cell spread,type 1 membrane protein;
   contains a signal peptide;possible membrane fusogen; complexed with envelope
   glycoprotein L.

25.thymidine kinase,nucleotide metabolism.

26.nuclear protein UL24,function unknown.

27.DNA packaging tegument protein UL25,function DNA encapsidation,located on
   capsid near vertices; possibly stabilizes the capsid and retains the genome.

28.capsid maturation protease,function capsid morphogenesis,serine protease
   (N-terminal region);minor scaffold protein (remainder of protein, clipped
   near C terminus);VP24; VP21.

29.capsid scaffold protein,capsid morphogenesis,clipped near C terminus; VP22a.

30.envelope glycoprotein B,function cell entry,cell-to-cell spread,type 1
   membrane protein;contains a signal peptide;possible membrane fusogen; binds
   cell surface heparan sulphate.

31.DNA packaging terminase subunit 2,DNA encapsidation,

32.single-stranded DNA-binding protein,function DNA replication,possibly
   gene regulation,contains a zinc-finger; ICP8.

33.DNA polymerase catalytic subunit,DNA replication.

34.nuclear egress lamina protein,function nuclear egress,single-stranded
   DNA-binding protein.

35.DNA packaging protein UL32,function DNA encapsidation,possibly capsid
   transport.

36.DNA packaging protein UL33,function DNA encapsidation,interacts with DNA
   packaging terminase subunit 2.

37.nuclear egress membrane protein,function nuclear egress,type 2 membrane
   protein; interacts with nuclear, egress lamina protein.

38.small capsid protein,function capsid morphogenesis; possibly capsid
   transport,located externally on capsid hexons; VP26.

39.large tegument protein,function capsid transport,complexed with tegument
   protein UL37,ubiquitin-specific protease (N-terminal region); VP1/2.

40.tegument protein UL37,virion morphogenesis,complexed with large tegument
   protein.

41.capsid triplex subunit 1,capsid morphogenesis,complexed 1:2 with capsid
   triplex subunit 2 to connect capsid hexons and pentons; VP19C.

42.ribonucleotide reductase subunit 1,nucleotide metabolism.

43.ribonucleotide reductase subunit 2,nucleotide metabolism.

44.tegument host shutoff protein,function cellular mRNA degradation,mRNA-specific
   RNase; frameshifted in this strain;presented as non-frameshifted.

45.DNA polymerase processivity subunit,DNA replication dsDNA-binding protein.

46.envelope protein UL43,function possibly membrane fusion,type 3 membrane
   protein; 11 transmembrane domains.

47.envelope glycoprotein C,function cell attachment,type 1 membrane protein;
   contains a signal peptide;binds cell surface heparan sulphate; binds
   complement C3b to block neutralization.

48.membrane protein UL45,function possibly membrane fusion,type 2 membrane
   protein; tegument-associated.

49.tegument protein VP11/12,function possibly gene regulation,modulates
   transactivating tegument protein VP16.

50.tegument protein VP13/14,function possibly gene regulation,modulates
   transactivating tegument protein VP16;RNA-binding protein.

51.transactivating tegument protein VP16,gene regulation,virion morphogenesis,
   transactivates immediate early genes.

52.tegument protein VP22,function virion morphogenesis,possibly RNA transport
   to uninfected cells.

53.envelope glycoprotein N,function virion morphogenesis,membrane fusion,type
   1 membrane protein; contains a signal peptide;complexed with envelope
   glycoprotein M.

54.deoxyuridine triphosphatase,nucleotide metabolism.

55.tegument protein UL51,virion morphogenesis.

56.helicase-primase primase subunit,DNA replication.

57.envelope glycoprotein K,function virion morphogenesis,membrane fusion,type 3
   membrane protein; contains a signal peptide;4 transmembrane domains.

58.multifunctional expression regulator,function gene regulation,RNA metabolism
   and transport,RNA-binding protein; shuttles between nucleus and cytoplasm;
   inhibits pre-mRNA splicing; exports virus mRNA from nucleus; exerts most effects
   post-transcriptionally;ICP27; MER family.

59.nuclear protein UL55,function unknown.

60.membrane protein UL56,function possibly vesicular trafficking,type 2 membrane
   protein; interacts with kinesin motor protein KIF1A; UL56 family.

61.ubiquitin E3 ligase ICP0,function gene regulation,cellular protein degradation,
   latency,contains a RING finger; disrupts ND10;proteasome-dependent degradation
   of several cellular proteins.

62.neurovirulence protein ICP34.5,function translational regulation,virion protein;
   inhibits stress-induced translational arrest; related to eIF2 phosphatase
   regulatory subunit GADD34; binds protein phosphatase 1 to form a holoenzyme
   capable of dephosphorylating eIF2-alpha.

63.transcriptional regulator ICP4,gene regulation.

64.regulatory protein ICP22,function gene regulation,cell cycle regulation,
   required for expression of a subset of late genes.

65.virion protein US2,function unknown,possibly envelope-associated;
   interacts with cytokeratin 18.

66.serine/threonine protein kinase US3,function protein phosphorylation,apoptosis,
   nuclear egress,tegument protein; phosphorylates nuclear egress lamina protein;
   mediates phosphorylation of HDAC1 and HDAC2 and other cellular and viral proteins;
   PK family.

67.envelope glycoprotein G,function cell-to-cell spread,type 1 membrane protein;
   contains a signal peptide;gD family.

68.envelope glycoprotein J,function unknown,type 1 membrane protein; contains
   a signal peptide.

69.envelope glycoprotein D,function cell attachment,type 1 membrane protein;
   contains a signal peptide; binds cell surface receptors; gD family.

70.envelope glycoprotein I,function cell-to-cell spread,type 1 membrane protein;
   contains a signal peptide;complexed with envelope glycoprotein E to form an
   Fc-receptor; gD family.

71.envelope glycoprotein E,function cell-to-cell spread,type 1 membrane protein;
   contains a signal peptide;complexed with envelope glycoprotein I to form an
   Fc-receptor; gE family.

72.membrane protein US8A,function unknown,type 2 membrane protein.

73.membrane protein US9,function axonal transport,type 2 membrane protein;
   tegument-associated;localizes envelope proteins.

74.virion protein US10,function unknown.

75.tegument protein US11,function translational regulation,dsRNA-binding protein;
   antagonizes PKR; inhibits stress-induced translational arrest.

76.TAP transporter inhibitor ICP47,function immune regulation,inhibits
   antigen presentation.

77.transcriptional regulator ICP4,gene regulation.
---------------------------------------------------------------------------------
77 белков FASTA ФОРМАТ.ПРИЛОЖЕНИЕ 2.Цитирование из генных баз NCBI USA.
WWWNCBI.NLM.NIH.GOV.

----------------------------------------------